201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0268 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  70.73 
 
 		 212 aa  301  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  64.62 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.53 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.4 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  60.7 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  62.62 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 209 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  56.46 
 
 		 211 aa  237  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  59.52 
 
 		 215 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  60.91 
 
 		 208 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  57.62 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  59.6 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  58.21 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  55.5 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  57.5 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  53.77 
 
 		 217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  57.89 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 202 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 202 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 202 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  54.33 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  56 
 
 		 214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 200 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  53.24 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  51.15 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 		 211 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  49.77 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.99 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  34.42 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  44.58 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.86 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  34.13 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.07 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.45 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0041  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  27.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.53 
 
 		 382 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.1 
 
 		 365 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.86 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.1 
 
 		 365 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.1 
 
 		 365 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  41.03 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.57 
 
 		 427 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>