More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3081 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  100 
 
 		 653 aa  1305    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  46.98 
 
 		 652 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  46.82 
 
 		 652 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  49.08 
 
 		 617 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  47.13 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  43.97 
 
 		 658 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 768 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  25.05 
 
 		 707 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 459 aa  125  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  26.41 
 
 		 464 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  25.19 
 
 		 729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  28.9 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  29.06 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  26.94 
 
 		 464 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  26 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  27.73 
 
 		 464 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  28.53 
 
 		 463 aa  100  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 510 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  32.93 
 
 		 277 aa  97.8  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 441 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.19 
 
 		 543 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.89 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.93 
 
 		 320 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 229 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.42 
 
 		 509 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 544 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 229 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 434 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 451 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 229 aa  90.1  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 525 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.38 
 
 		 320 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.86 
 
 		 321 aa  88.6  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.6 
 
 		 422 aa  88.2  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 215 aa  88.2  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.17 
 
 		 229 aa  88.2  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.98 
 
 		 230 aa  88.2  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 537 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  31.02 
 
 		 316 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 671 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.45 
 
 		 510 aa  87.4  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.96 
 
 		 233 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.35 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  29.8 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  37.27 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  53.49 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  30.58 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 498 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  43 
 
 		 229 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.75 
 
 		 402 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.75 
 
 		 310 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.75 
 
 		 310 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 638 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  39.84 
 
 		 214 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 230 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.39 
 
 		 247 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.46 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 193 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.43 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.57 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  36.21 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.03 
 
 		 694 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  42.31 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  35.56 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  39.84 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.17 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.42 
 
 		 320 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.35 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.12 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  34.45 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.85 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  39.05 
 
 		 890 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>