182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0494 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  41.08 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  41.08 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  40.45 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  38.71 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  44.02 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  37.31 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  29.8 
 
 		 617 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  31.44 
 
 		 613 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  29.86 
 
 		 422 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.66 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.9 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  30.32 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.47 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  27.88 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  29.41 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.24 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.11 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.99 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  30.26 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  31.06 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.05 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  27.39 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  32.45 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  29.68 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.86 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  31.87 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  29.61 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.95 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.37 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  34.21 
 
 		 524 aa  67  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  22.58 
 
 		 411 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  30.52 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  24.86 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  31.03 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  23.05 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  26.6 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  24.91 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  27.48 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.52 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  25.75 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  27.8 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  24.91 
 
 		 437 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  23.89 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  23.84 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.48 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  23.49 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28.5 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  31.43 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  23.48 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  22.93 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  23.98 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  23.16 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.37 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.4 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.22 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  22.97 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  25.71 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.61 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  29.08 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  27.47 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  25.71 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.42 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  24.73 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  23.45 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  23.45 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  23.45 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  23.45 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  23.45 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  25.97 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.48 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  23.49 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  24.63 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  23.02 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  26.2 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  29.1 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.41 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.84 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  22.83 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  24.86 
 
 		 414 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  40.98 
 
 		 423 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  22.96 
 
 		 435 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  25.63 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  26.17 
 
 		 419 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  22.18 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  25.59 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  28.64 
 
 		 527 aa  52.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>