More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13891 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  65.74 
 
 		 209 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  40.58 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 309 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.17 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>