More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11104 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  83.65 
 
 		 265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  82.51 
 
 		 263 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  83.67 
 
 		 263 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  83.67 
 
 		 263 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  84.19 
 
 		 246 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  71.71 
 
 		 281 aa  362  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  62.21 
 
 		 260 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  59.06 
 
 		 255 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  56.47 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.47 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  56.08 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  55.51 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  55.12 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.04 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  55.73 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.94 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.91 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  53.39 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  53.52 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  51.57 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  51.94 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  51.37 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  53.12 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.94 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  50.98 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  54.4 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  53.94 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.39 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.2 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  51.17 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  48.64 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.61 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.34 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.4 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  48.24 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.02 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  43.07 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  38.75 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.67 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  43.07 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.13 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.19 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  35.6 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  34.58 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.62 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.41 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.22 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.48 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.55 
 
 		 247 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  38.93 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  40.76 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.49 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.68 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.51 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  35.47 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.07 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.29 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.91 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  41.88 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  34.19 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  35.47 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  34.17 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  34.43 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.19 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  37.83 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  35.9 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.85 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.75 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  34.03 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  35.71 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 249 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  34.33 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  35.17 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>