More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3635 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  87.25 
 
 		 354 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  100 
 
 		 356 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  64.87 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  28.01 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  27.35 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  27.76 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.49 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.48 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  28.32 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.7 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  26.7 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  28.57 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.21 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  26.81 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.33 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  22.61 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  27.73 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.32 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.68 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.43 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.65 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  24.18 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.71 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  22.85 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.05 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  21.31 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  30.95 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  27.27 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  24.77 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.42 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.87 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  25.44 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  24.92 
 
 		 3337 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  24.77 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  23.34 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.52 
 
 		 1107 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.84 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.76 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  22.02 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  26.88 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  37.76 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  21.61 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  22.97 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  22.22 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  22.22 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.54 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.11 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  25.51 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  23.19 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.19 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  22.22 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.08 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.7 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  23.19 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  21.64 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.62 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  20.45 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  21.43 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  33.04 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  24.46 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  32.73 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  22.25 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.96 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  25.47 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.74 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  24.54 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.67 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  32.31 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.79 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.91 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  27.49 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  25.33 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  29.21 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  25.53 
 
 		 6889 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  21.55 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.91 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  22.83 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  23.03 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  31.17 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  32.32 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.47 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.85 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  30.15 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.49 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  23.93 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.43 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  30.15 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.43 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  30.15 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  22.68 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.43 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>