More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3416 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 703 aa  1452    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  41.31 
 
 		 742 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  38.72 
 
 		 739 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 767 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  42.58 
 
 		 526 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  37.61 
 
 		 741 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  34.81 
 
 		 649 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  35.15 
 
 		 642 aa  304  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  33.9 
 
 		 620 aa  229  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 836 aa  177  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 		 1021 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.36 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 838 aa  167  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 571 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  30 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.22 
 
 		 814 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.39 
 
 		 490 aa  150  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 524 aa  150  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.75 
 
 		 576 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.87 
 
 		 1891 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 		 609 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.44 
 
 		 1942 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.39 
 
 		 564 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.05 
 
 		 885 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.55 
 
 		 2638 aa  144  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  32.6 
 
 		 752 aa  144  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 619 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.73 
 
 		 593 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.28 
 
 		 574 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  23.95 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  25.48 
 
 		 610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.82 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.01 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.41 
 
 		 1975 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 		 614 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 623 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.61 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.61 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.74 
 
 		 599 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.52 
 
 		 623 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  26.45 
 
 		 630 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.26 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  26.68 
 
 		 609 aa  128  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.36 
 
 		 1005 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 488 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.71 
 
 		 533 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.37 
 
 		 2068 aa  125  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  25.84 
 
 		 644 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 914 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  26.34 
 
 		 572 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.62 
 
 		 472 aa  121  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 641 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  28.27 
 
 		 639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 1017 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 481 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 683 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.74 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 562 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 487 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  25.58 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.2 
 
 		 481 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 631 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 588 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  24.22 
 
 		 610 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 481 aa  110  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.49 
 
 		 604 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  28.8 
 
 		 654 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 		 595 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  24.32 
 
 		 610 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.19 
 
 		 586 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.88 
 
 		 584 aa  107  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.82 
 
 		 575 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  26 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.73 
 
 		 496 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.31 
 
 		 1855 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  26.09 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.24 
 
 		 515 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 499 aa  105  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.67 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.05 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 765 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.72 
 
 		 593 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 925 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>