192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0136 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 793 aa  1648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  34.2 
 
 		 854 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  34.2 
 
 		 854 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  34.2 
 
 		 855 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  33.79 
 
 		 854 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  33.59 
 
 		 860 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  33.86 
 
 		 855 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 855 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  37.76 
 
 		 779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  33.63 
 
 		 855 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  34.84 
 
 		 795 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  37.44 
 
 		 779 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  34.56 
 
 		 824 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  34.34 
 
 		 795 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  34.24 
 
 		 841 aa  429  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  34.43 
 
 		 804 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  32.92 
 
 		 852 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  33.08 
 
 		 770 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  35.94 
 
 		 737 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  33.72 
 
 		 772 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  33.12 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  33.67 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  33.33 
 
 		 773 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  33.46 
 
 		 763 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  33.51 
 
 		 762 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  32.99 
 
 		 760 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  33.46 
 
 		 769 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  32.28 
 
 		 778 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  32.29 
 
 		 819 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  35.12 
 
 		 773 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  31.48 
 
 		 816 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  32.42 
 
 		 842 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  33.25 
 
 		 799 aa  347  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  31.18 
 
 		 814 aa  342  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  31.31 
 
 		 805 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  28.82 
 
 		 789 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  25.31 
 
 		 694 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  24.37 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  24.77 
 
 		 674 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.64 
 
 		 725 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  23.61 
 
 		 718 aa  157  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.31 
 
 		 712 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.16 
 
 		 724 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  22.21 
 
 		 827 aa  118  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.28 
 
 		 701 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  23.13 
 
 		 827 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  21.86 
 
 		 818 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.24 
 
 		 809 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.3 
 
 		 809 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  22.93 
 
 		 821 aa  97.8  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.04 
 
 		 823 aa  96.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  24.05 
 
 		 833 aa  95.9  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  22.04 
 
 		 817 aa  95.5  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  23.32 
 
 		 738 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.89 
 
 		 796 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.63 
 
 		 796 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.89 
 
 		 796 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.89 
 
 		 796 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.05 
 
 		 796 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.89 
 
 		 796 aa  92  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.89 
 
 		 796 aa  91.3  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.49 
 
 		 796 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.69 
 
 		 796 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  25.42 
 
 		 821 aa  87.8  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.14 
 
 		 811 aa  87.4  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.49 
 
 		 796 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  22.03 
 
 		 795 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  23.05 
 
 		 804 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  21.78 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  22.69 
 
 		 804 aa  82  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  25.29 
 
 		 803 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  22.36 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  23.17 
 
 		 808 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  21.36 
 
 		 792 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  20.29 
 
 		 795 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  23.95 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  23.49 
 
 		 821 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.15 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.36 
 
 		 761 aa  75.5  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.57 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.51 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  23.47 
 
 		 770 aa  75.5  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  23.01 
 
 		 843 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  22.87 
 
 		 813 aa  75.5  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  21.74 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  26.26 
 
 		 874 aa  74.7  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  25.65 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  23.81 
 
 		 857 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  24.46 
 
 		 906 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  21 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  22.66 
 
 		 848 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  20.29 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  22.58 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  21.39 
 
 		 809 aa  71.2  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.89 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  23.55 
 
 		 818 aa  71.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  22.92 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25 
 
 		 903 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.39 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.05 
 
 		 807 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>