More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  57.05 
 
 		 710 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  100 
 
 		 642 aa  1259    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.91 
 
 		 707 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  36.03 
 
 		 709 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  36.13 
 
 		 730 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  37.77 
 
 		 688 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  38.93 
 
 		 686 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  35.99 
 
 		 686 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  37.48 
 
 		 705 aa  347  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  33.87 
 
 		 901 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.89 
 
 		 703 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  34.13 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  32.36 
 
 		 707 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 725 aa  248  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 727 aa  243  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 213 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  37 
 
 		 222 aa  104  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 426 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 226 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 215 aa  87.4  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  32.38 
 
 		 216 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  32.04 
 
 		 210 aa  85.5  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  35.14 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  34.72 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  32.85 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  35.6 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  32.62 
 
 		 225 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 205 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  30.62 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  26.8 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  33.33 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  34.17 
 
 		 225 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.83 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  33.18 
 
 		 212 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.42 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  33.16 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  29.6 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  33.16 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  33.16 
 
 		 219 aa  76.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  37.88 
 
 		 219 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  26.77 
 
 		 208 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  30.66 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  31.94 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  30.65 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  31.13 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  31.12 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  35.66 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  30.95 
 
 		 211 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  29.44 
 
 		 225 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  25.89 
 
 		 207 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  32.06 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  30.23 
 
 		 236 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  28.91 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  31.75 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  26.26 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  31.87 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  37.32 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  27.5 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  30.39 
 
 		 209 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  27.88 
 
 		 226 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  30.61 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  30.21 
 
 		 215 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  28.8 
 
 		 210 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  29.02 
 
 		 211 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  28.72 
 
 		 217 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  27.63 
 
 		 236 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  25.37 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  26.67 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  27.03 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  26.89 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  28.84 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  26.09 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.85 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.24 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  29.65 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  29.35 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  28.97 
 
 		 215 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  36.43 
 
 		 236 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  29 
 
 		 230 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  31.37 
 
 		 214 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  28.65 
 
 		 218 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  28.8 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>