93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 		 331 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3550  glycoside hydrolase family 25  44.66 
 
 		 372 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0276847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5643  glycoside hydrolase family 25  45.57 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  38.05 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2829  glycoside hydrolase family 25  38.1 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000963865  hitchhiker  0.0000533641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7372  glycoside hydrolase family 25  32.75 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  30.24 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  29.38 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  28.44 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  27.56 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  27.4 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.11 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  28.38 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.11 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  30.1 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  28.83 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  35.45 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  29.06 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  28.57 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  27.73 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  27.65 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  26.81 
 
 		 935 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  28.31 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  28.5 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  28.37 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  28.84 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  28.37 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  24.55 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  26.5 
 
 		 592 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  27.91 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  36.84 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  36.84 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  43.33 
 
 		 574 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  27.4 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  36.05 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  39.19 
 
 		 259 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  30.95 
 
 		 491 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 261 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  28.31 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  32.61 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  32.61 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  32.61 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  27.78 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  26.98 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  29.81 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  29.91 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  27.44 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 496 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  30.56 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  29.91 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1801  glycoside hydrolase family 25  24.55 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.783073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  33.68 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  27.16 
 
 		 411 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  28.91 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  33.68 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  23.74 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  37.7 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  35.64 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  28.29 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  28.85 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  27.59 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1519  glycoside hydrolase family 25  26.27 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  23.48 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0144  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 231 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  28.85 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  26.36 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 829 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  29.41 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  24.88 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  26.51 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0023  glycoside hydrolase family 25  27.05 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>