103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0855 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0855  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
385 aa  785    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.817782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  25.57 
 
 
666 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  25.57 
 
 
666 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.55 
 
 
675 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  27.48 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.21 
 
 
666 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.59 
 
 
675 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  25.06 
 
 
604 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  23.68 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.73 
 
 
689 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.73 
 
 
689 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.73 
 
 
689 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.56 
 
 
672 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.17 
 
 
672 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.37 
 
 
668 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  20.76 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.37 
 
 
668 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.99 
 
 
673 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.37 
 
 
668 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  23.14 
 
 
631 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.87 
 
 
668 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  23.12 
 
 
668 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.14 
 
 
657 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  23.12 
 
 
668 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  21.51 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.62 
 
 
668 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.28 
 
 
668 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  23.32 
 
 
682 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  22.08 
 
 
699 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.25 
 
 
666 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.62 
 
 
666 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.49 
 
 
672 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.25 
 
 
668 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.25 
 
 
666 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.25 
 
 
666 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.79 
 
 
672 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.72 
 
 
666 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.23 
 
 
675 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.62 
 
 
659 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
350 aa  56.6  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2377  hypothetical protein  23.06 
 
 
667 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1284  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.93 
 
 
613 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000566158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1471  hypothetical protein  22.02 
 
 
707 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  20.42 
 
 
660 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24 
 
 
676 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1694  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.11 
 
 
674 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00252388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0496  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.18 
 
 
621 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.59 
 
 
654 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.41 
 
 
654 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.65 
 
 
657 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  20.38 
 
 
585 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.57 
 
 
665 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.86 
 
 
667 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  31.13 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 
454 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.61 
 
 
654 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1861  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  22.28 
 
 
661 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.12 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  44.44 
 
 
416 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1070  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.17 
 
 
680 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.388206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1404  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.38 
 
 
613 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.628111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.08 
 
 
672 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2446  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
680 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000288925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  20.21 
 
 
622 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  30.67 
 
 
705 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  22 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1208  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.41 
 
 
612 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  40 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  42.22 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.58 
 
 
612 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  40 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  40 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0457  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
613 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000895922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  40 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  40.98 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  27.66 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  40.98 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  40.98 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  40 
 
 
419 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  40.68 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  40.68 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  40.98 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 
537 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  40.98 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  40.98 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  30.99 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1390  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
697 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 
537 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1481  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
754 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000425578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  40.98 
 
 
369 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  20.62 
 
 
372 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.05 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
435 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>