87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3354 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.96 
 
 
2237 aa  931    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.737065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1941  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.07 
 
 
2263 aa  931    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.86 
 
 
2065 aa  988    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.59 
 
 
3705 aa  800    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0317  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.97 
 
 
2756 aa  731    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0319  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.01 
 
 
2139 aa  829    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0326  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.16 
 
 
2123 aa  853    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.372271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.52 
 
 
2209 aa  2388    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0512  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.29 
 
 
2210 aa  1793    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0561  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.47 
 
 
2280 aa  784    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  35.47 
 
 
2091 aa  770    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0755  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.52 
 
 
2786 aa  739    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0013  Autotransporter beta- domain protein  34.78 
 
 
2276 aa  1052    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0960  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.97 
 
 
2236 aa  1053    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0966  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.74 
 
 
2844 aa  819    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0967  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.51 
 
 
2266 aa  920    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0983  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.39 
 
 
2309 aa  926    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0987  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.07 
 
 
2337 aa  819    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0988  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.18 
 
 
2270 aa  838    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.81 
 
 
2751 aa  809    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1469  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.65 
 
 
3689 aa  801    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1720  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.58 
 
 
2309 aa  825    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.92642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1591  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.69 
 
 
2739 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2290  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.49 
 
 
2229 aa  1047    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  54.42 
 
 
2225 aa  2213    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.53 
 
 
2138 aa  704    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.2 
 
 
2370 aa  1010    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3710  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.33 
 
 
2270 aa  947    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.799117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3516  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.48 
 
 
2747 aa  690    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3437  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.69 
 
 
2321 aa  776    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3436  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.31 
 
 
2114 aa  801    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.292491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3391  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.55 
 
 
2788 aa  764    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3371  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.11 
 
 
2245 aa  767    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.638586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3354  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
2216 aa  4360    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2417  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.05 
 
 
2655 aa  665    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2133  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.92 
 
 
2305 aa  778    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.837933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2332  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40 
 
 
2435 aa  978    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2359  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.24 
 
 
2267 aa  835    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2748  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.58 
 
 
2297 aa  952    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.57 
 
 
2800 aa  742    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.86 
 
 
2437 aa  986    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.02 
 
 
2407 aa  957    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.98 
 
 
2596 aa  623  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3240  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.61 
 
 
2760 aa  615  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0331  hypothetical protein  38.21 
 
 
2656 aa  580  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1462  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.31 
 
 
2730 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0721  Autotransporter beta- domain protein  25.95 
 
 
3918 aa  209  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0989  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.33 
 
 
3685 aa  195  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4034  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.38 
 
 
3750 aa  193  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0311  hypothetical protein  24.87 
 
 
2342 aa  134  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1779  hypothetical protein  47.65 
 
 
169 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4191  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.25 
 
 
2310 aa  133  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0902  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52 
 
 
2358 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0728  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.17 
 
 
1256 aa  108  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.23429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.25 
 
 
1251 aa  105  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  24.76 
 
 
1951 aa  97.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2240  Autotransporter beta- domain protein  24.42 
 
 
1107 aa  97.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.400804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.85 
 
 
1048 aa  93.6  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.91 
 
 
826 aa  91.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  25.19 
 
 
1984 aa  84  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  23.39 
 
 
1940 aa  77.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  23.94 
 
 
1923 aa  75.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  23.94 
 
 
1941 aa  74.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  24.16 
 
 
1982 aa  74.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  26.25 
 
 
2637 aa  57  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2980  hypothetical protein  37.5 
 
 
549 aa  55.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.13 
 
 
1489 aa  54.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  20.91 
 
 
980 aa  55.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.9 
 
 
3954 aa  54.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.92 
 
 
1322 aa  53.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  26 
 
 
4238 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  26 
 
 
4238 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.5 
 
 
1029 aa  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2635  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.23 
 
 
1068 aa  51.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  21.78 
 
 
1016 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  26 
 
 
3822 aa  51.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.68 
 
 
906 aa  50.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.45 
 
 
1464 aa  49.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  22.41 
 
 
1459 aa  48.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  27.96 
 
 
1067 aa  49.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  23.35 
 
 
1458 aa  48.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.26 
 
 
1769 aa  48.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  20.17 
 
 
983 aa  48.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  21.53 
 
 
1130 aa  47.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  22.92 
 
 
1001 aa  47  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.52 
 
 
926 aa  46.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.74 
 
 
1369 aa  46.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>