More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2341 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 
695 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  47.01 
 
 
723 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  46.38 
 
 
726 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  50.58 
 
 
697 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  46.7 
 
 
723 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  48.15 
 
 
734 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  48.42 
 
 
716 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  48.28 
 
 
717 aa  677    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.49 
 
 
697 aa  661    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  45.92 
 
 
726 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  46.87 
 
 
721 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  45.05 
 
 
723 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.48 
 
 
706 aa  638    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  47.14 
 
 
727 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
702 aa  1441    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  53.67 
 
 
699 aa  765    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  47.27 
 
 
718 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 
695 aa  736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  46.02 
 
 
723 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  50.22 
 
 
695 aa  700    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  46 
 
 
721 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  48.99 
 
 
695 aa  723    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.51 
 
 
696 aa  640    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 
695 aa  729    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  46.44 
 
 
725 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  46.72 
 
 
725 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  46.07 
 
 
726 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  57.94 
 
 
676 aa  796    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  49.57 
 
 
697 aa  710    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.72 
 
 
705 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  53.47 
 
 
701 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  50.64 
 
 
697 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 
702 aa  734    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  44.76 
 
 
722 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  46.98 
 
 
711 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  46.41 
 
 
730 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.59 
 
 
728 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  45.93 
 
 
733 aa  622  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 
703 aa  620  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  45.35 
 
 
697 aa  617  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  44.26 
 
 
723 aa  615  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.98 
 
 
727 aa  609  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  44.86 
 
 
713 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  44.62 
 
 
730 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  44.23 
 
 
712 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  43.57 
 
 
727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.51 
 
 
729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  43.92 
 
 
724 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  43.86 
 
 
714 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  43.14 
 
 
714 aa  601  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  43.27 
 
 
729 aa  595  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  42.86 
 
 
722 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.47 
 
 
732 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  42.48 
 
 
714 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  43.76 
 
 
724 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  44.24 
 
 
724 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  42.53 
 
 
729 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  42.9 
 
 
728 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  40.2 
 
 
699 aa  532  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 
688 aa  529  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.7 
 
 
716 aa  456  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.87 
 
 
688 aa  446  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 
439 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  24.55 
 
 
452 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35.21 
 
 
450 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.45 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.45 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  25.51 
 
 
439 aa  64.3  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.57 
 
 
430 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.3 
 
 
456 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
444 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 
439 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  33.7 
 
 
446 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 
439 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  28.27 
 
 
446 aa  62.4  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  26.64 
 
 
437 aa  61.2  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  28.14 
 
 
454 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  25.93 
 
 
441 aa  60.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  26.48 
 
 
446 aa  60.5  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  22.96 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  30.07 
 
 
473 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  27.01 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  28.74 
 
 
454 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  28.74 
 
 
459 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  28.74 
 
 
454 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  28.1 
 
 
442 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>