More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1841 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  50 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  41.03 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  41.15 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  43.52 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  36.6 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  39.29 
 
 		 254 aa  110  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  38.22 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  39.29 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  37.42 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  35.23 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  35.71 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  31.77 
 
 		 217 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  34.31 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.48 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  34.67 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  35 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.65 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.5 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  30.33 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  31.44 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  34.08 
 
 		 233 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  36.22 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  32.26 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  32.22 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  34.87 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  34.57 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 213 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  33 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  34.86 
 
 		 232 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  33.9 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  33.9 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  32.99 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  30.81 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  32.31 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  30.85 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.85 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  32.85 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  30.61 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.47 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  32.84 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  35.71 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.72 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  32.09 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  32.21 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  32.09 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  34.86 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  32.99 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  30.92 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  37.57 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  31.02 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  31.61 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  31.61 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  34.13 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  30.92 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  27.71 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  28.02 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  32.84 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>