More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1902 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  100 
 
 
255 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  66.96 
 
 
291 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  66.96 
 
 
291 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  66.96 
 
 
291 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  67.86 
 
 
291 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  67.41 
 
 
291 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  61.99 
 
 
299 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  62.95 
 
 
303 aa  235  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  67.86 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  59.38 
 
 
291 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  71.61 
 
 
296 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  59.39 
 
 
257 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  65.05 
 
 
298 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  55.61 
 
 
292 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  44.67 
 
 
254 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  51.09 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  35.86 
 
 
266 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  36.97 
 
 
268 aa  144  9e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  42.67 
 
 
282 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
265 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  53.3 
 
 
256 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  36.17 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  36.71 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  42.41 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  39.04 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  39.57 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  33.97 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  37.75 
 
 
250 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  42.61 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.44 
 
 
252 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  40.34 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  37.99 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  37.92 
 
 
265 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  39.47 
 
 
256 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  40.26 
 
 
257 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  44.75 
 
 
259 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  37.65 
 
 
275 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  40.35 
 
 
257 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  40.35 
 
 
257 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  40.35 
 
 
257 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 
275 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 
271 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  31.62 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  36.07 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  37.05 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  35.91 
 
 
290 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.78 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  37.07 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  37.84 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.85 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  37.4 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.56 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35.4 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  36.82 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  35.19 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.31 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.78 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  37.62 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  37.91 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.77 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  35.65 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  38.5 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.71 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  37.89 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.09 
 
 
2798 aa  76.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  33.07 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.02 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  31.53 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  30.09 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  31.58 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  33.66 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  27.38 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  29.06 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  29.65 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.63 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.61 
 
 
304 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  29.49 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  29.65 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  42.05 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3462  hypothetical protein  31.71 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  31.33 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.42 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.89 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  37.24 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  32.08 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  29.95 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.69 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  32.44 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  37.24 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  29.82 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.67 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>