More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1294 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  100 
 
 		 401 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  73.5 
 
 		 403 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  56.48 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  51.63 
 
 		 448 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  47.76 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  42.38 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  38.72 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  37.34 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  41.56 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  35.61 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  37.62 
 
 		 418 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  35.06 
 
 		 397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  37.06 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  37.4 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  38.35 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  38.44 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.55 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.41 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  41.91 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  33.58 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.33 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  37.26 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  36.53 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  37.64 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.5 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  34.64 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  40.07 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  32.31 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  36.41 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.42 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  33.67 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.74 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  36.13 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  29.5 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  34.61 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.42 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.67 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.17 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  36.34 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.98 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.57 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.84 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.51 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  38.67 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.5 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  36.41 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  29.38 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.02 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  29.56 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  30.03 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  30.03 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  30.03 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  37.75 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  30.03 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  30.03 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.34 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  28.01 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.34 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  37.31 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  28.29 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.14 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.43 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  35.13 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.07 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  33.93 
 
 		 408 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.5 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.55 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.13 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  34.38 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  34.26 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.91 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  28.68 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  31.2 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.26 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28.8 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.6 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  35.62 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  28.54 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  28.34 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.93 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.57 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.93 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.93 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.93 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.93 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.2 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.33 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.53 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.67 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>