118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2514 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  82.3 
 
 		 428 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  80.62 
 
 		 429 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  81.1 
 
 		 429 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  79.25 
 
 		 429 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  893    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  81.03 
 
 		 448 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  80.8 
 
 		 448 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  81.03 
 
 		 448 aa  742    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  57.53 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  57.8 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  54.35 
 
 		 467 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  55.63 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  50.81 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  36.23 
 
 		 430 aa  269  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  36.51 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  37.1 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  36.97 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  34.26 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.53 
 
 		 443 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.36 
 
 		 1498 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  29.85 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.62 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  28.94 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  28.47 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  29.77 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  28.54 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  25.63 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  25.63 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  25.63 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  26.6 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  25.76 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  27.31 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  28.61 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  26.85 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  26.8 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  23.06 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  26.09 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.7 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  23.4 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  25.07 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  25.89 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  25.27 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  21.72 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  25 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  26.27 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  23.29 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.25 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.46 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  23.08 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  22.95 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  25.13 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.82 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  25.57 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  26.03 
 
 		 908 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  25.6 
 
 		 1005 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.2 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.4 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  22.25 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.07 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  24.73 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.18 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  23.22 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  25.69 
 
 		 1010 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  24.63 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.5 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  22.83 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  23.94 
 
 		 839 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.55 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  23.18 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  25.26 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1010 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  22.9 
 
 		 1029 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  24.94 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  23.08 
 
 		 1029 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  25.23 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  25.37 
 
 		 1024 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  24.28 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  24.34 
 
 		 1018 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  22.48 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.3 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  23.11 
 
 		 1024 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  24.4 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  21.88 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  23.72 
 
 		 1021 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  20.29 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.94 
 
 		 1020 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  22.57 
 
 		 1024 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  23.76 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  23.27 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  23.1 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  22.68 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  27.59 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  28.28 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  28.28 
 
 		 376 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  28.28 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  37.68 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  28.28 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>