More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2783 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  67.89 
 
 
188 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  67.37 
 
 
188 aa  262  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  67.37 
 
 
188 aa  262  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  66.32 
 
 
188 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  64.17 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  65.24 
 
 
199 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  58.6 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  51.61 
 
 
189 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  48.95 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  52.75 
 
 
193 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  48.47 
 
 
199 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  45.21 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  44.21 
 
 
190 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  47.54 
 
 
195 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  47.54 
 
 
200 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  47.54 
 
 
195 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  43.92 
 
 
204 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
185 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
185 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  43.37 
 
 
200 aa  148  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  44.15 
 
 
187 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  43.62 
 
 
187 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 
187 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 
187 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 
188 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
187 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 
187 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 
187 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  39.23 
 
 
187 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
191 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  68.49 
 
 
84 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.73 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 
213 aa  84.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.14 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.8 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.89 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.85 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  29.57 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
235 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  39.42 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.48 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  36.36 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.95 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.95 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.95 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.95 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>