More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1779 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  78.3 
 
 		 1015 aa  1612    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  85.43 
 
 		 1025 aa  1798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.08 
 
 		 1026 aa  1037    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  76.25 
 
 		 1020 aa  1631    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  87.61 
 
 		 1027 aa  1853    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1025 aa  2079    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  75.68 
 
 		 1030 aa  1620    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  39.49 
 
 		 1026 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  78.1 
 
 		 1015 aa  1608    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  78.3 
 
 		 1015 aa  1612    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  51.66 
 
 		 1040 aa  1013    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  78.15 
 
 		 1018 aa  1641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  77.76 
 
 		 1018 aa  1634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  75.76 
 
 		 1021 aa  1617    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  77.81 
 
 		 1015 aa  1660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  78.3 
 
 		 1015 aa  1612    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  77.85 
 
 		 1018 aa  1608    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  71.9 
 
 		 1019 aa  1541    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  80.94 
 
 		 1015 aa  1726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  37.72 
 
 		 823 aa  532  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1011 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1053 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1046 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1050 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1044 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1024 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1040 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1034 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1043 aa  376  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1034 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1071 aa  363  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1009 aa  360  5e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1017 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1044 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.3 
 
 		 1024 aa  356  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1032 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1014 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1038 aa  350  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1058 aa  350  9e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1022 aa  348  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 1496 aa  346  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1027 aa  343  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1173 aa  342  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1043 aa  341  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1023 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1036 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1470 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1050 aa  336  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1075 aa  334  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1045 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1041 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1006 aa  331  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1039 aa  330  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.57 
 
 		 1058 aa  330  9e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1027 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  26.72 
 
 		 1030 aa  327  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1028 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1055 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1039 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1065 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1059 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1067 aa  325  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.14 
 
 		 1069 aa  324  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  23.67 
 
 		 1053 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1038 aa  324  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1044 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1028 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1040 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1034 aa  320  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1072 aa  319  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  26.86 
 
 		 1064 aa  318  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1026 aa  318  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1063 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1041 aa  317  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1026 aa  317  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1074 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.28 
 
 		 1036 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1028 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1054 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1062 aa  312  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1030 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1047 aa  312  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1067 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1033 aa  311  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1041 aa  311  4e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1054 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.45 
 
 		 1050 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1041 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.22 
 
 		 1058 aa  307  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.76 
 
 		 1040 aa  307  7e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1048 aa  306  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1054 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1101 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1044 aa  303  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1048 aa  303  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.98 
 
 		 1014 aa  302  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1070 aa  302  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>