More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0456 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  713    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  78.03 
 
 		 341 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  32.45 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  32.45 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.98 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  31.97 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.27 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  31.52 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.18 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.98 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  30.13 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.81 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  31.55 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  28.14 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  31.67 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.48 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  27.73 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  27.73 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  27.73 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  29.46 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  29.46 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  29.46 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.61 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  29.63 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.63 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  29.63 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  29.63 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  29.63 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  29.63 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  29.63 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  29.32 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  29.32 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  29.32 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  27.04 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  31.02 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  29.04 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.88 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  27.86 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.59 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  25.57 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  27.25 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.09 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.22 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  25.55 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.23 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.46 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  26.82 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.9 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  26.98 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.46 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.06 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25.41 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  30.23 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  24.44 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  25.29 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  35.88 
 
 		 195 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.81 
 
 		 670 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  25.23 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  23.53 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.8 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.78 
 
 		 533 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 175 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.57 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  41.57 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  41.57 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.8 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  33.91 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  27.64 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.24 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  31.29 
 
 		 1793 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0604  OmpA domain-containing protein  30.3 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.303363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.79 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  31.75 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  32.43 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 673 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.96 
 
 		 607 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>