More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2898 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  51.52 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  42.37 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40.44 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  41.18 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  32.58 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  32.58 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  38.74 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.84 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  44.32 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 		 510 aa  61.6  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  36.28 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  36.28 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  30.53 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  31.39 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  33.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  30.53 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  29.08 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>