More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1073 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  46.53 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  45.85 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 211 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 211 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  44.38 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  35.03 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.42 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  35.53 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  36.82 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  31.79 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>