196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6020 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 351 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  44.12 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.59 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.76 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.78 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.8 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.6 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  32.45 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  30.94 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.26 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  30.86 
 
 		 249 aa  116  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.23 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.67 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.78 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.83 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  28.78 
 
 		 727 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 731 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 525 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  25.53 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  25.4 
 
 		 731 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.53 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.6 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.01 
 
 		 294 aa  99.4  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.32 
 
 		 545 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.13 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  23.7 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.77 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  26.25 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 558 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.06 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.27 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  24.5 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  24.5 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.24 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.51 
 
 		 398 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  35.21 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 598 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.4 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.34 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  37.93 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.42 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  27.46 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  30.34 
 
 		 691 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.84 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  28.39 
 
 		 553 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.18 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  26.12 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.92 
 
 		 402 aa  85.9  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  25.62 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.35 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.95 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.23 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.59 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  24.21 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  31.52 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.46 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  27.6 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.38 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.12 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.69 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.08 
 
 		 550 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.39 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  28.76 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  25.79 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.39 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.84 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.46 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  29.46 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  29.48 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.87 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  24.89 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  26.83 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.9 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  30.99 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  26.18 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.55 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  26.67 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25.5 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.48 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.6 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.47 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  32.65 
 
 		 207 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.66 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  25.73 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  28.19 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  23.36 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.3 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.22 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.6 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  27.8 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>