More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1555  ABC transporter related  66.96 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  58.22 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  49.78 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  53.49 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  51.11 
 
 		 565 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.61 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  47.88 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  45.79 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.5 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2803  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.05 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  45.5 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  44.29 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  47.09 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  47.51 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  43.06 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.7 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  42.93 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  45.91 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  48.86 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  48.86 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.59 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  49.1 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.22 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  48.94 
 
 		 563 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.58 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  40.47 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  45.33 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  44.98 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  41.82 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  47 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.5 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  44.86 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  45.12 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.78 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 254 aa  178  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  43.5 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  45.37 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.46 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  44.64 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  44.24 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  44.65 
 
 		 241 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  45.33 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  47.25 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.71 
 
 		 646 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  45.18 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.33 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  42.92 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  44.6 
 
 		 715 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.33 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  44.75 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  44.75 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  44.75 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>