More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2516 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  99.8 
 
 		 1015 aa  2059    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  90.18 
 
 		 1020 aa  1900    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1015 aa  2063    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  93.79 
 
 		 1015 aa  1956    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1026 aa  693    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  76.64 
 
 		 1030 aa  1616    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  78.17 
 
 		 1027 aa  1665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1015 aa  2063    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1040 aa  996    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  92.34 
 
 		 1018 aa  1912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  92.24 
 
 		 1018 aa  1909    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  77.35 
 
 		 1021 aa  1642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  92.53 
 
 		 1018 aa  1883    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  76.98 
 
 		 1025 aa  1630    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  74.23 
 
 		 1019 aa  1565    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.11 
 
 		 1026 aa  1025    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  78.3 
 
 		 1025 aa  1657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1015 aa  2063    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  78.78 
 
 		 1015 aa  1673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  38.41 
 
 		 823 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1011 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 		 1024 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1053 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1046 aa  392  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1044 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1043 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1050 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1040 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1044 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1009 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1038 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1032 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1027 aa  357  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1071 aa  356  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 1496 aa  353  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1058 aa  352  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1041 aa  351  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1014 aa  350  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1041 aa  350  7e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1017 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1034 aa  347  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1027 aa  347  8.999999999999999e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1043 aa  345  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1470 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.68 
 
 		 1024 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1026 aa  344  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1039 aa  341  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.06 
 
 		 1036 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1036 aa  337  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1022 aa  335  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1006 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1023 aa  334  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1028 aa  334  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1028 aa  333  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1041 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  27.41 
 
 		 1064 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1050 aa  329  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1065 aa  328  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1058 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1063 aa  327  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1058 aa  327  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1038 aa  327  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1047 aa  326  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.54 
 
 		 1050 aa  325  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.99 
 
 		 1069 aa  325  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.94 
 
 		 1049 aa  324  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1015 aa  324  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1053 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  23.84 
 
 		 1039 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1045 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1055 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1059 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1026 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1044 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1074 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1033 aa  314  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1040 aa  314  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1075 aa  313  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1044 aa  314  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1173 aa  313  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1101 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 		 1016 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1030 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1054 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1041 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1042 aa  308  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1054 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1067 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1048 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1062 aa  305  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1046 aa  304  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1028 aa  304  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1054 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1171 aa  302  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1031 aa  302  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1041 aa  301  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>