267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3313 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  82.06 
 
 		 603 aa  1050    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  82.23 
 
 		 603 aa  1054    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  100 
 
 		 603 aa  1262    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  81.89 
 
 		 603 aa  1050    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  82.06 
 
 		 603 aa  1050    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  82.06 
 
 		 603 aa  1052    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  82.06 
 
 		 603 aa  1053    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  54.74 
 
 		 598 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  82.06 
 
 		 603 aa  1054    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  82.23 
 
 		 603 aa  1054    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  55.7 
 
 		 590 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  51.83 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  44.56 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  45.35 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  43.31 
 
 		 599 aa  508  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  44.04 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  43.89 
 
 		 588 aa  480  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  49.39 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  40.44 
 
 		 601 aa  477  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  36.59 
 
 		 563 aa  359  9e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  35.26 
 
 		 564 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  32.76 
 
 		 558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  29.06 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  29.25 
 
 		 607 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 598 aa  200  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  27.71 
 
 		 603 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.56 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.14 
 
 		 587 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.23 
 
 		 591 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.82 
 
 		 600 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25.98 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  50.29 
 
 		 188 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.86 
 
 		 670 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 686 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  27.93 
 
 		 897 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.63 
 
 		 625 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.55 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 894 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.53 
 
 		 707 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 888 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  27.62 
 
 		 1043 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.85 
 
 		 972 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.88 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.93 
 
 		 677 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.5 
 
 		 862 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  25.48 
 
 		 1024 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 1084 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.04 
 
 		 848 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.89 
 
 		 1084 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.57 
 
 		 1129 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.36 
 
 		 743 aa  133  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.89 
 
 		 892 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 803 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.82 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.81 
 
 		 889 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.91 
 
 		 992 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  25.62 
 
 		 1036 aa  130  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.64 
 
 		 1076 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.85 
 
 		 858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 781 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.49 
 
 		 750 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.1 
 
 		 923 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.71 
 
 		 1108 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.54 
 
 		 717 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.45 
 
 		 781 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.64 
 
 		 929 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  25.34 
 
 		 1024 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.64 
 
 		 1033 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 984 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  26.5 
 
 		 1003 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.18 
 
 		 815 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  24.47 
 
 		 704 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 1079 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.24 
 
 		 992 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  27.07 
 
 		 1017 aa  123  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  24.28 
 
 		 1032 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.14 
 
 		 1063 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.93 
 
 		 1424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.43 
 
 		 1005 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.41 
 
 		 986 aa  121  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 623 aa  120  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  27.42 
 
 		 1012 aa  120  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.57 
 
 		 1013 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.75 
 
 		 1030 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.97 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.95 
 
 		 1019 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.37 
 
 		 1053 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  24.27 
 
 		 1035 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.33 
 
 		 1041 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 806 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.95 
 
 		 614 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 1094 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2089  Beta-glucuronidase  43.86 
 
 		 132 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.9 
 
 		 763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  27.86 
 
 		 1023 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.54 
 
 		 1046 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  26.49 
 
 		 1032 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.51 
 
 		 1059 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  24.96 
 
 		 1029 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  25.86 
 
 		 1024 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>