197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0201 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  100 
 
 		 180 aa  361  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  90 
 
 		 179 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  88.89 
 
 		 179 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  89.44 
 
 		 177 aa  314  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  83.15 
 
 		 183 aa  294  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.51 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  36.94 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.96 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  34.57 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  33.91 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  33.91 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  33.91 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  34.39 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  35.26 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  33.51 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.99 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  35.19 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.78 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.78 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.78 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  32.78 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  32.78 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  33.12 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.5 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  32.5 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  34.59 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.59 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  36.02 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.5 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  32.28 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.03 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.5 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  33.96 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  33.96 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  33.96 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  33.96 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  33.96 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  31.14 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  33.96 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  32.28 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.28 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.28 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.28 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.28 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.73 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  32.28 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  33.96 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  32.28 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.59 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.59 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.59 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  33.54 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  32.48 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.95 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  33.74 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32.95 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32.95 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32.95 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  34.59 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.98 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  32.03 
 
 		 345 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.81 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.81 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.81 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.81 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  32.03 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  32.03 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  33.77 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  34.4 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.38 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.22 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.48 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.48 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.48 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  32.02 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  32.02 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.48 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5936  fimbrial protein  31.63 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  32.02 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  32.02 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  30.38 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>