75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5936 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5936  fimbrial protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.81 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.81 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.81 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  26.56 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  26.56 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  26.56 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.8 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.95 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  29.9 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  31.63 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.65 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.43 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.65 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  32.16 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  28.64 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28.04 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  28.64 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  28.9 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.42 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.42 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.67 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.42 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  28.87 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  30.18 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  30.18 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  30.18 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  29.01 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30.05 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  29.01 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  27.5 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  24.73 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  27.86 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  29.24 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  29.59 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  27.81 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  27.17 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  27.81 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  27.81 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  27.81 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  27.42 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  26.56 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.95 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  26.56 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.95 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  26.56 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.95 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  26.32 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.91 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.22 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  24.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.37 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  26.22 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  27.38 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  26.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  31.53 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  26.44 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  24.73 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  35.06 
 
 		 285 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  24.73 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.28 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>