More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3760 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  98.04 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  98.04 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  97.55 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  89.22 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  75 
 
 		 202 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  74.26 
 
 		 210 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  73.76 
 
 		 206 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  73.85 
 
 		 203 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  57.37 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  54.97 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  40.59 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  40.21 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  43.26 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  40.96 
 
 		 172 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  39.77 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  37.29 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  36.25 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  38.12 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  37.95 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  38.42 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.79 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  36.92 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  39.55 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  38.79 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.08 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  36.94 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  39.49 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  37.85 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  37.85 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  38.37 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.76 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.35 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  41.51 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  32.35 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  33.54 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  35.87 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  27.47 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  31.07 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  27.88 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  27.7 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.34 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  29.14 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.84 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.49 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  27.53 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.68 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  27.53 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.65 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  26.78 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  28.41 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>