274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1804 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  81.89 
 
 		 603 aa  1050    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  100 
 
 		 603 aa  1264    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  99.17 
 
 		 603 aa  1254    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  99.17 
 
 		 603 aa  1254    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  99.34 
 
 		 603 aa  1257    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  99 
 
 		 603 aa  1253    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  54.52 
 
 		 590 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  99.17 
 
 		 603 aa  1256    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  53.57 
 
 		 598 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  99 
 
 		 603 aa  1252    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  99.34 
 
 		 603 aa  1257    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  51.99 
 
 		 644 aa  623  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  45.03 
 
 		 577 aa  537  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  46.2 
 
 		 598 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  44.21 
 
 		 596 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  45.54 
 
 		 588 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  42.46 
 
 		 599 aa  485  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  40.77 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  48.25 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  34.93 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  34.27 
 
 		 564 aa  336  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  33.1 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.6 
 
 		 607 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  29.82 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28.08 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25.33 
 
 		 597 aa  190  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.81 
 
 		 591 aa  189  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  27.82 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.76 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.5 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  49.14 
 
 		 188 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.68 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.51 
 
 		 625 aa  163  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.93 
 
 		 897 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.12 
 
 		 670 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.84 
 
 		 707 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.32 
 
 		 677 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.17 
 
 		 1076 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.26 
 
 		 738 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.89 
 
 		 1024 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.07 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25 
 
 		 862 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.23 
 
 		 894 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.34 
 
 		 972 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.06 
 
 		 743 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 888 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.39 
 
 		 848 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 1094 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.83 
 
 		 1019 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  26.15 
 
 		 1020 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.38 
 
 		 923 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.49 
 
 		 750 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  27.93 
 
 		 1043 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 1077 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 889 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.67 
 
 		 704 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.26 
 
 		 992 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  25.7 
 
 		 1036 aa  134  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.76 
 
 		 1108 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.06 
 
 		 1084 aa  133  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 1079 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.45 
 
 		 1033 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.34 
 
 		 1059 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.07 
 
 		 781 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  26.08 
 
 		 984 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.8 
 
 		 1063 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 1084 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2089  Beta-glucuronidase  47.37 
 
 		 132 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.44 
 
 		 1030 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.55 
 
 		 1424 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  27.9 
 
 		 1012 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.98 
 
 		 1041 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  25.72 
 
 		 1050 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  25.72 
 
 		 1066 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  25.72 
 
 		 1066 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.64 
 
 		 824 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  28.47 
 
 		 1032 aa  124  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.19 
 
 		 1045 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 		 992 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.58 
 
 		 903 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.89 
 
 		 1129 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.53 
 
 		 1289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  23.42 
 
 		 928 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.83 
 
 		 747 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.08 
 
 		 1015 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  25.36 
 
 		 763 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  24.91 
 
 		 1024 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.17 
 
 		 1026 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.34 
 
 		 717 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.28 
 
 		 748 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.07 
 
 		 1013 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.71 
 
 		 1046 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.85 
 
 		 614 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.75 
 
 		 986 aa  120  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  24.74 
 
 		 1044 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 858 aa  120  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.82 
 
 		 1017 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>