More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1035 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  97.74 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  98.19 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  97.29 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  97.29 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  81.45 
 
 		 221 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  81.45 
 
 		 221 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  81 
 
 		 221 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  81.45 
 
 		 221 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  81.45 
 
 		 221 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  55.86 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  40.64 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  38.98 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  37.85 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  38.98 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  37.29 
 
 		 183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  32.3 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  32.3 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.48 
 
 		 432 aa  88.6  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  33.78 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  30.34 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  30.66 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.71 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  29 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  28.03 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.65 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.65 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  29.35 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  32.02 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  29.28 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  25.12 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  25.48 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  25.48 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  30.25 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  43.24 
 
 		 845 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  29.27 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  28.91 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  26.63 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  28.45 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  28.45 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 1031 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  76.67 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  36.84 
 
 		 848 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 1022 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  53.33 
 
 		 872 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  24.19 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  69.44 
 
 		 1113 aa  58.9  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 1017 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  29.84 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 896 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  26.95 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  70.97 
 
 		 1118 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  23.11 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 1136 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 1029 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  50.85 
 
 		 897 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  63.89 
 
 		 1102 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  38.38 
 
 		 910 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  34.35 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  47.54 
 
 		 900 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  45.76 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  45.76 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  45 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  28.31 
 
 		 896 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 888 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 858 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  27.76 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  49.23 
 
 		 897 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  32.82 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  47.92 
 
 		 1200 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  45.61 
 
 		 916 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  65.71 
 
 		 917 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 897 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  66.67 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 912 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 894 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  86.36 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 844 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 958 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  36.84 
 
 		 544 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  52.63 
 
 		 837 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 907 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 421 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 910 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 		 901 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 909 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 907 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>