More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1386 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  88.03 
 
 
743 aa  1071    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
761 aa  1461    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  41.9 
 
 
743 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  40.54 
 
 
740 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.29 
 
 
729 aa  449  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  40.32 
 
 
750 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.65 
 
 
735 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.07 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.07 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  41.5 
 
 
737 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  40.86 
 
 
723 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.41 
 
 
842 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.84 
 
 
752 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.09 
 
 
735 aa  416  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  39.45 
 
 
876 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  38.99 
 
 
758 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.46 
 
 
751 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.78 
 
 
893 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.11 
 
 
732 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  37.5 
 
 
717 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  40.27 
 
 
723 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  39.7 
 
 
832 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  39.09 
 
 
715 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  39.16 
 
 
731 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.94 
 
 
760 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.26 
 
 
711 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.04 
 
 
718 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.3 
 
 
735 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  35.6 
 
 
779 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  35.95 
 
 
735 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.86 
 
 
726 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.42 
 
 
772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.42 
 
 
772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.42 
 
 
772 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  37.88 
 
 
728 aa  365  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  37.71 
 
 
737 aa  361  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  38.5 
 
 
734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.24 
 
 
749 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  37.47 
 
 
793 aa  358  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.51 
 
 
734 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.09 
 
 
724 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  34.94 
 
 
920 aa  357  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.08 
 
 
796 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  36.11 
 
 
787 aa  352  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  38.32 
 
 
755 aa  349  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  38.79 
 
 
724 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  34.47 
 
 
742 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.46 
 
 
781 aa  346  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.34 
 
 
917 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  35.49 
 
 
909 aa  343  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  36.28 
 
 
732 aa  343  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.28 
 
 
704 aa  341  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  38.79 
 
 
714 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.26 
 
 
779 aa  334  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.72 
 
 
1002 aa  324  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.33 
 
 
746 aa  324  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.09 
 
 
1382 aa  323  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.76 
 
 
741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  35.21 
 
 
787 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  36.61 
 
 
958 aa  303  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  36.45 
 
 
903 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.84 
 
 
791 aa  299  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  35.24 
 
 
734 aa  297  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  34.91 
 
 
1058 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.02 
 
 
978 aa  294  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.06 
 
 
979 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.06 
 
 
983 aa  293  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.06 
 
 
983 aa  293  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  37.7 
 
 
1092 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.75 
 
 
758 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.2 
 
 
784 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  35.93 
 
 
843 aa  288  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.91 
 
 
854 aa  287  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.7 
 
 
740 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  50.27 
 
 
776 aa  286  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.86 
 
 
968 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.68 
 
 
737 aa  284  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  34.82 
 
 
766 aa  280  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.04 
 
 
743 aa  278  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.56 
 
 
732 aa  276  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  35.93 
 
 
840 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  35.39 
 
 
966 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.24 
 
 
846 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  34.13 
 
 
807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  37.25 
 
 
903 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.66 
 
 
805 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 
733 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.94 
 
 
729 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.97 
 
 
738 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  35.14 
 
 
717 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.84 
 
 
745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.03 
 
 
710 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.04 
 
 
737 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  32.88 
 
 
737 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.1 
 
 
751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  34.21 
 
 
718 aa  244  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  30.33 
 
 
770 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.82 
 
 
741 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  37.18 
 
 
741 aa  243  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  35.63 
 
 
726 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>