More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2474 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  73.62 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  73.62 
 
 		 203 aa  261  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  73.01 
 
 		 203 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  75.16 
 
 		 177 aa  258  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  75 
 
 		 230 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  75 
 
 		 179 aa  257  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  75 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  75 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  71.34 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  68.59 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  63.16 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 182 aa  190  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  47.65 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  53.85 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 184 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  53.85 
 
 		 176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  52.56 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  51.28 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  52.56 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  51.92 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 183 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 212 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  50 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 180 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  49.04 
 
 		 202 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  45 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  44.17 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.74 
 
 		 205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  40.24 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.11 
 
 		 231 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 213 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 231 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  40.24 
 
 		 191 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.07 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  42.04 
 
 		 233 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.93 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  44.16 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  40.52 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  45.19 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  47.18 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  45.67 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  43.62 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  40.37 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  40.37 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  40.37 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  46.38 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  42.45 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  42.55 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  35.06 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  45.74 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  39.01 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  40.43 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  43.97 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.75 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  38.03 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  47.66 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  41.38 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  40 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  45.33 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  42.86 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.3 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  41.73 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  38.3 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  44.09 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  42.77 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  44.88 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  42.03 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  40.77 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>