More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1629 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1729  hypothetical protein  56.07 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00956707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  49.22 
 
 
318 aa  299  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  35.21 
 
 
377 aa  160  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  29.34 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  33.66 
 
 
337 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  30.51 
 
 
796 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  30.51 
 
 
796 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  31.2 
 
 
966 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  28.89 
 
 
790 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  32.57 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  31.9 
 
 
574 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.38 
 
 
793 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.87 
 
 
452 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.87 
 
 
428 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28.15 
 
 
784 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4212  beta-lactamase  29.26 
 
 
343 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  30.25 
 
 
459 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  30.43 
 
 
483 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  30.38 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  30.42 
 
 
395 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  32.02 
 
 
379 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.48 
 
 
582 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26.06 
 
 
717 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.59 
 
 
408 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0220  putative secreted esterase  29.11 
 
 
339 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  28.42 
 
 
416 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  28.44 
 
 
381 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  27.95 
 
 
369 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.4 
 
 
390 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  28.61 
 
 
395 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.73 
 
 
361 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  27.69 
 
 
792 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1130  beta-lactamase  26.52 
 
 
355 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  25.91 
 
 
366 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  29.92 
 
 
1012 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  28.57 
 
 
566 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  27.27 
 
 
785 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  24.72 
 
 
990 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  28.16 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  28.06 
 
 
591 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  28.65 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  27.43 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  28.01 
 
 
391 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25.95 
 
 
385 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.44 
 
 
392 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  26.56 
 
 
1007 aa  93.2  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  26.9 
 
 
430 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.51 
 
 
379 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  25 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  25.96 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  29.43 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.71 
 
 
1018 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  26.15 
 
 
1003 aa  89.4  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  25.65 
 
 
471 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  30.04 
 
 
496 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  26.33 
 
 
434 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.23 
 
 
953 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  26.04 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  26 
 
 
434 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  24.26 
 
 
651 aa  86.3  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  25.25 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  25.25 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  26 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  28.01 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  25.67 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  26 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  28.42 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  25.82 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  26 
 
 
434 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  26.98 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  24.56 
 
 
597 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  23.38 
 
 
665 aa  80.1  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  28.52 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  24.18 
 
 
531 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  25.96 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  26.76 
 
 
818 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  28.37 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  32.5 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.13 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  25.25 
 
 
603 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  23.2 
 
 
484 aa  72.8  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3808  beta-lactamase  24.16 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00436578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.45 
 
 
431 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  26.81 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  29.44 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.81 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  24.07 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.44 
 
 
5698 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.86 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.05 
 
 
537 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  24.83 
 
 
432 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  24.83 
 
 
432 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  24.83 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  24.83 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  23.92 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  21.11 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.43 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  22.75 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0784108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>