More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1367 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  617  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  72.58 
 
 
301 aa  447  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 
301 aa  333  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
298 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  34.81 
 
 
302 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 
304 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  32.65 
 
 
308 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 
307 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  34.93 
 
 
307 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
290 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
301 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 
313 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  32.76 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  28.71 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 
307 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  29.67 
 
 
219 aa  99.8  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 
307 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  44.79 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.08 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.08 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.08 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1195  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279757  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.65 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01942  probable transcriptional regulator  30.72 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.22412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  27.01 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.67 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  25.66 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  24.5 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.08 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.18 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.18 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.18 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.18 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.18 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.65 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1252  transcriptional regulator, LysR family  22.22 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  27.96 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  27.78 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  23.57 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.7 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  29.38 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  21.38 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.22 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  27.97 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4505  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  21.38 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0858  transcriptional regulator  27.23 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.311751  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.7 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0799  transcriptional regulator  27.23 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0827  transcriptional regulator  27.23 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3155  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0890  transcriptional regulator  27.23 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.36 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.36 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  26.09 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.36 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>