31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0410 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  63.13 
 
 		 217 aa  281  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  35.41 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  35.12 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 290 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 304 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 301 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  31.68 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 307 aa  131  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  34.76 
 
 		 317 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 313 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 301 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 301 aa  95.1  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 298 aa  86.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6140  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6428  LysR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.410616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  19.02 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 313 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  23.84 
 
 		 305 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 316 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>