More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0935 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  58.82 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  57 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  61.22 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  58.22 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  53.92 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 		 304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  50.84 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  49.66 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  36.36 
 
 		 217 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  35.41 
 
 		 219 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1045  fhu operon transcription regulator  24.5 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0140074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  25.08 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.43 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6428  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.410616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.35 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2079  HTH-type transcriptional regulator  27.09 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6140  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1783  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  27.19 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  41.77 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  24.84 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  30.05 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  24.23 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  24.27 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  29.33 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>