More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1649 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  100 
 
 		 317 aa  645    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  59.15 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  58.22 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  53.64 
 
 		 304 aa  340  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  55.22 
 
 		 302 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  48.84 
 
 		 307 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  48.4 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 290 aa  301  9e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  45.51 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  43.52 
 
 		 308 aa  272  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  35.61 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  34.76 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  29.52 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3783  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  25.97 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1045  fhu operon transcription regulator  21.85 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0140074  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  23.65 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  25.27 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  44.87 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4580  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal  0.669632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4124  transcriptional regulator, LysR family  48.05 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2998  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1783  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0256  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2701  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3051  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  26.18 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  24.25 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3086  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  25.4 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  25.4 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  25.4 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  25.4 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3369  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  25.4 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  26.06 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  28.02 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  28.02 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  28.02 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  31.8 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  28.7 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>