More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0757 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  31.35 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  32.77 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  27.39 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  27.48 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  25.32 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0809  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  26.57 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  25.24 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  24.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  24.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  24.84 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  24.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  38.27 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.02 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  24.37 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1121  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  23.15 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4124  transcriptional regulator, LysR family  24.04 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  26.27 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  25.25 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  26.94 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3902  transcriptional regulator LysR family  24.56 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.14 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  24.38 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3385  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  24.52 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4180  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0851648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  24.14 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4350  transcriptional regulator MetR  26.83 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>