More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3737 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  634    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  50.33 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  33.76 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0809  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  25.87 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  30.52 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0054  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  29.19 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.67 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.67 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2450  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.33 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2202  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2038  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  24.8 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  29.81 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.54 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  27.45 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  25.08 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  27.54 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  22.93 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.84 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  28.85 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.36 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  25.78 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  26.36 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  26.36 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  22.29 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  26.36 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  27.06 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  25 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.5 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.5 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  25.97 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  25.97 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>