More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1238 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  33.65 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  24.27 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  25.89 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  25.47 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  27.36 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  28.51 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  29.38 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  23.3 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0827  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0890  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0799  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0858  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.311751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4828  transcriptional regulator, LysR family  23.85 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4315  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  25.98 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  27.23 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  21.26 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  32.26 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  32.17 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  34.62 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  27.23 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05060  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  47.76 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2332  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  28.64 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5230  LysR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208833  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  44.74 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  40.79 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0830  transcriptional regulator, LysR family  25.83 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.0341942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  26.24 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0620  transcriptional regulator, LysR family  25.29 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  28.43 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1431  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>