More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0525 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  638    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  80.13 
 
 		 310 aa  531  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  58.82 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  48.84 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  49.51 
 
 		 313 aa  314  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  51.53 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  47.96 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  33.17 
 
 		 217 aa  136  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  31.68 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  23.47 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0232  fhu operon transcription regulator  27.3 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1045  fhu operon transcription regulator  24.68 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0140074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  25.72 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  23.17 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  31.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  24.67 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  23.58 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  46.84 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  26.09 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0830  transcriptional regulator, LysR family  24.51 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.0341942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3612  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11328  normal  0.0439826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  27.32 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  32.08 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  24.17 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  25 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  30.99 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  24.16 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  32.08 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  23.57 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  30 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>