More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1045 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1045  fhu operon transcription regulator  100 
 
 		 306 aa  636    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0140074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0232  fhu operon transcription regulator  42.48 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  24.5 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  24.68 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2679  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  24.09 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  21.85 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  25.39 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  25.89 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.67 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.75 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0620  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  24.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  23.72 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  23.72 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  24.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0307  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  24.31 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  24.31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2313  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  24.31 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1200  transcriptional regulator CysB  27.92 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  24.39 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.3 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  23.76 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.82 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  24.08 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  23.53 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  22.17 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  24.08 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  23.81 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2646  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  20.26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  22.33 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  24.04 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>