More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1845 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 308 aa  636    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1847  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  39.23 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13090  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.393584  normal  0.531505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  33.14 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  26.29 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2675  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  30.05 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  30.05 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  33.71 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  30.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  30.57 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.72 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.72 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  29.41 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33.72 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.72 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  24.41 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  33.14 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.72 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  33.72 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  25.58 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3718  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0727  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.849989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0198  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>