More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1176 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  597  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  78.6 
 
 		 302 aa  472  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  55.96 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  51.99 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  52.11 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  48.74 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  47.87 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  47.65 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  45.85 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  43.32 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  35.96 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  35.1 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  21.15 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  20.76 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  22.57 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  26.84 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0809  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.06 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  20.76 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  23.83 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  23.83 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4893  transcriptional regulator, LysR family  24.89 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0696189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2778  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  23.94 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  21.62 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2818  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238125  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  22.73 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2737  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.093098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  27.32 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2953  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.93 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2841  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.619943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  21.14 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  25.64 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2079  HTH-type transcriptional regulator  24.77 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  23.56 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.79 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  26.56 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  23.75 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1027  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  21.21 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5191  LysR family transcriptional regulator  19.6 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.35 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  19.35 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.35 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3681  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  23.75 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  22.65 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.35 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  19.35 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>