59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08390 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  63.13 
 
 		 219 aa  281  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  35.1 
 
 		 302 aa  141  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  33.97 
 
 		 310 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  33.65 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  33.17 
 
 		 307 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 307 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 308 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  35.61 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 313 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 418 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  21.26 
 
 		 305 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  23.33 
 
 		 300 aa  45.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.31 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  21.18 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  25.88 
 
 		 308 aa  42  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  23.57 
 
 		 293 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.04 
 
 		 304 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.04 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>