More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2052 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2052  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304694  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3445  GntR family transcriptional regulator  85.78 
 
 		 211 aa  330  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0532986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3090  GntR family transcriptional regulator  85.78 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268358  normal  0.787214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  38.41 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  31.78 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.72 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.2 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  33.8 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.2 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2521  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2558  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2566  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.520739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.29 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.16 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>