204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3271 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  93.43 
 
 		 333 aa  618  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  38.56 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  39.88 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  39.88 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.44 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  34.08 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  28.3 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  31.64 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  28.05 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3801  transcriptional regulator, MerR family  25.48 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000260127  hitchhiker  0.0000000000000558476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  27.39 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 298 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1411  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1544  transcriptional regulator, MerR family  24.62 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00914127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1072  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.653703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1371  MerR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000540169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1583  transcriptional regulator, MerR family  26.86 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53357e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1399  MerR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1509  MerR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1650  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1370  MerR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000206673  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  28.7 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  26 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  24.81 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41410  transcriptional regulatory protein, MerR-family  29.69 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  29.41 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  34.06 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  34.06 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 293 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1614  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.38 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  36.65 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  26.84 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  27.11 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  35.62 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  29.39 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  29.86 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  21.27 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  29.92 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4927  MerR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  26.51 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  30.94 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  31.39 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  25.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>