282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2796 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  59.16 
 
 
550 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  72.54 
 
 
546 aa  792    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
543 aa  1105    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  85.61 
 
 
547 aa  963    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  39.36 
 
 
562 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  39.03 
 
 
561 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  37.52 
 
 
562 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 
618 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  33.87 
 
 
607 aa  286  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  32.92 
 
 
609 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  35.17 
 
 
583 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  32.56 
 
 
605 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  32.76 
 
 
594 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 
601 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 
647 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 
589 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  31.66 
 
 
414 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 
608 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 
570 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
573 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  27.01 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 
655 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  22.94 
 
 
565 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 
559 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
615 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
547 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
536 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  24.36 
 
 
534 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 
583 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  22.54 
 
 
587 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  24.95 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
814 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  32.21 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 
564 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  22.02 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
514 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 
513 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 
972 aa  70.1  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
480 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  23.71 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
522 aa  67  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
500 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 
412 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
599 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  35.29 
 
 
523 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.95 
 
 
560 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  32.52 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  32.89 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 
593 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 
315 aa  60.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  22.74 
 
 
588 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  24.41 
 
 
596 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.15 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.33 
 
 
691 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  22.26 
 
 
515 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.18 
 
 
729 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.51 
 
 
740 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 
334 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  34.04 
 
 
505 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.47 
 
 
753 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 
490 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  25.53 
 
 
371 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  35.96 
 
 
761 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
328 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.22 
 
 
680 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  21.36 
 
 
355 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.8 
 
 
725 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 
415 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  36.59 
 
 
352 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 
819 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
336 aa  57  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  35.67 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 
335 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
583 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.22 
 
 
671 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  35.9 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 
1356 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 
335 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  34.36 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  37.4 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  28 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  28 
 
 
380 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 
571 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
418 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.57 
 
 
751 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.03 
 
 
712 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
462 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.57 
 
 
755 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 
324 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 
315 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>