More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1836 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  871    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  85 
 
 		 440 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  58.86 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  53.53 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  32.88 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  35.41 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  32.47 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  33.85 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.45 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  28.41 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  35.18 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  32.1 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  33.25 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.46 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.73 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.03 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  33.02 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  35.42 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  29.9 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  33.86 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.67 
 
 		 447 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.84 
 
 		 443 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  30.91 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.38 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  31.54 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.44 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  29.07 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  32.53 
 
 		 449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  32.46 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  32.46 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.35 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  31.33 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  31.82 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.14 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  28.27 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.79 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  30.91 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  31.66 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  29.18 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  27.41 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 		 294 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.16 
 
 		 295 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.05 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  90.1  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 		 294 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  30.84 
 
 		 432 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.27 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  27.41 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.88 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  32.46 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.88 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.91 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 302 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.27 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  29.21 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.97 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.74 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  24.87 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.46 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  30.46 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.33 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.11 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  23.96 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.04 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.66 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  29.95 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.35 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.25 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.31 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  24.38 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  20.74 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>